L’unité de Mycologie est une unité sous contrat (USC) avec INRAE. Elle consacre ses activités aux champignons et oomycètes (autres organismes microscopiques filamenteux) phytopathogènes sur toutes les cultures végétales, les forêts, et les plantes ornementales. Elle est également membre du LabEx ARBRE (Recherches avancées sur la biologie de l’arbre et les écosystèmes forestiers),

Activités de référence

L’unité est Laboratoire national de référence (LNR) et depuis 2019 Laboratoire de référence de l'Union européenne (LRUE) sur la thématique « champignons et oomycètes phytopathogènes sur tous végétaux ».

Activités de recherche

Les activités de recherche de l’unité suivent trois axes principaux :

• le développement et la validation d’outils de détection et d’identification de champignons et d’oomycètes phytopathogènes pour une utilisation dans un cadre officiel et international. L’unité a mis au point de nombreux tests de détection utilisant des outils moléculaires (PCR, PCR en temps réel, LAMP (amplification isotherme médiée par les boucles)) ciblant une large gamme de ces organismes, dont la majorité font l’objet d’une réglementation européenne ;
• l'épidémiosurveillance et à la connaissance de ces champignons et oomycètes parasites. L’unité étudie les conditions de l’émergence de nouvelles maladies fongiques, et leur dispersion. Elle décrit également les nouvelles associations hôtes/parasites ;
• l’évaluation et l’exploitation de nouvelles technologies en matière de détection et d’identification, notamment les techniques basées sur le séquençage ADN à haut débit (métagénomique, génomique comparative). L’unité réalise de nombreux travaux impliquant ces technologies de pointe pour alimenter ses deux premiers axes de recherche.